Одной из особенностей деятельности Роспотребнадзора, отличающей его от деятельности других контролирующих органов и организаций, руководствующихся преимущественно КоАП РФ, является повсеместная обоснованность действий, опора на научные исследования, проводимые на базах 29 научно-исследовательских институтов гигиенического и эпидемиологического профилей, Управлений, федеральных бюджетных и казенных учреждений здравоохранения, работающих под флагом Роспотребнадзора. С большинством научно-исследовательских институтов Роспотребнадзора тесно взаимодействует и Управление Роспотребнадзора по Республике Алтай, преследуя цели развития наиболее актуальных, перспективных направлений научно-практической деятельности.

Повышение качества научно-практических работ за счет привлечения ведущих научных учреждений Роспотребнадзора, Министерства здравоохранения РФ предполагает своевременную идентификацию факторов риска и если не полную нейтрализацию, то существенное снижение их влияния на здоровье населения в результате реализации выработанных решений.

Только в 2013 году Управлением Роспотребнадзора по Республике Алтай подписаны соглашения о взаимодействии с ФБУН «Ростовский НИИ микробиологии и паразитологии», ФБУН «Тюменский  НИИ краевой инфекционной патологии», ФБУН «Федеральный научный центр медико-профилактических технологий управления рисками здоровью населения», ФБУН «Новосибирский НИИ гигиены». Продолжено взаимодействие с ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт радиационной гигиены имени профессора П.В. Рамзаева», ФБУН «Федеральный научный центр гигиены им. Ф.Ф. Эрисмана», ФБУН «Омский НИИ природноочаговых инфекций», ФКУЗ «Иркутский ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока», ФГБУ «НИИ экологии человека и гигиены окружающей среды им. А.Н. Сысина» с целью реализации научных подходов в работе специалистов санитарно-эпидемиологической службы.

Научный потенциал санитарно-эпидемиологической службы в Республики Алтай представлен двумя кандидатами медицинских наук, одним соискателем на получение ученой степени доктор медицинских наук, аспирантами медицинских ВУЗов, что способствует качественному подходу в научно-прогностическом обеспечении санитарно-эпидемиологического благополучия населения региона.

В настоящее время в службе имеют постоянное развитие 11 приоритетных направлений научно-практической деятельности, в том числе: эпидемиологический надзор за клещевыми инфекциями, изучение новых видов инфекций, вызываемых клещами;  эпидемиологический надзор за биогельминтозами Республики Алтай; влияние осуществления ракетно-космической деятельности на здоровье населения Республики Алтай; оценка влияния факторов внутришкольной среды на состояние здоровья учащихся; гигиеническая оценка фактического питания населения региона, формирование приверженности к здоровому образу жизни; перспективы использования региона в качестве зоны туристско-рекреационного типа, развитие туризма в регионе и прочее.

В 2013 году сотрудники службы приняли участие в 12 научно-практических, конференциях, совещаниях, семинарах, по актуальным проблемам обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия и защиты прав потребителей, проводимых Федеральной службой. Формы участия в конференциях были различными, в т.ч. выступлениями с докладами, публикациям, стендовыми докладами.

В 2013 году при непосредственном участии специалистов службы Роспотребнадзора Республики Алтай подготовлено 42 публикации, в т.ч. 8 в журналах ВАК.

18-19 сентября 2013 года на территории Республики Алтай проведена межрегиональная научно-практическая конференция «Основные проблемы охраны окружающей среды и обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Сибирском Федеральном округе, перспективы их решения». В Конференции приняли участие 86 специалистов органов и организаций Роспотребнадзора из 15 регионов Российской Федерации (Республики Алтай, Бурятия, Тыва, Хакасия; Алтайский, Забайкальский, Красноярский и Пермский края, Иркутская, Кемеровская, Новосибирская, Омская, Свердловская, Томская области, г.Санкт-Петербург).

На пленарных заседаниях заслушаны 35 докладов, отражающих всю совокупность научных направлений, по которым осуществляется деятельность Роспотребнадзора.

Материалы участников конференции нашли свое отражение в сборнике трудов, который  издан накануне и содержит в себе научно-исследовательские  работы 195 авторов, свидетельствующие о развитии теоретической и методической базы службы и расширении практики применения современных методов в надзорной деятельности.

По итогам конференции участники приняли резолюцию в которой отражены  основные направления деятельности органов и организаций Роспотребнадзора по дальнейшему совершенствованию работы в деле обеспечения охраны здоровья населения и обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия на территории Сибирского федерального округа.

Научные исследования сотрудников службы и научное сотрудничество продолжатся и в 2014 году. С  20.01.2014 по 22.01.2014 в Управлении Роспотребнадзора по Республике Алтай работала бригада ученых из  Новосибирского института терапии ФГБУ "НИИТПМ" СО РАМН и  Новосибирского НИИ гигиены. Основной целью работы была подготовка плана совместных действий  на 2014 год по изучению влияния на здоровье населения ракетно-космической деятельности, а также по планированию деятельности по изучению качества и безопасности пантовых ванн, расширения возможностей для использования территории Республики Алтай в целях рекреации населения  Сибирского федерального округа. Принят план совместной работы.

В феврале пройдут заседания региональных отделений Всероссийских научных обществ гигиенистов и эпидемиологов, обеспечивая новое качество реализации государственной политики в области профилактического здравоохранения.