Несмотря на то, что  БУЗ РА «Перинатальный центр» обслуживает рожениц со всей республики, здание Центра не оборудовано приточно-вытяжной вентиляцией. Автономной системой приточно-вытяжной вентиляции с механическим побуждением не обеспечен операционный блок. Из объяснений должностных лиц учреждения следует, что указанные нарушения не устраняются по причине отсутствия технической возможности, наличия резервного здания, соответствующего действующим санитарным нормам и правилам и отсутствия финансирования. Между тем, отсутствие системы вентиляции в помещениях Перинатального центра представляют угрозу распространения гнойно-септических инфекций  среди новорожденных и родильниц.

На необходимость приведения здания в соответствие действующим санитарным требованиям руководству учреждения указывалось неоднократно в ходе как плановых, так и внеплановых проверок. Очередная проверка в начале 2015 года показала, что нарушения не устранены.

За неисполнение предписания материалы в отношении юридического лица БУЗ РА «Перинатальный центр» переданы Роспотребнадзором в мировой суд, которым 13 марта текущего года принято решение о привлечении юридического лица к административной ответственности в виде штрафа.